Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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LSAMPQ13449 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
LSAMPQ13449 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
LSAMPQ13449 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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