Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PDAP1Q13442 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 PSG5-207ENST00000407568 1064 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PDAP1Q13442 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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