Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNTB2Q13425 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms