Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SRSF5Q13243 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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