Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
PRDM2Q13029 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM2Q13029 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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