Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC15Q0P6D6 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms