Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SRSF4Q08170 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms