Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SLC18A2Q05940 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms