Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms