Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CFHR1Q03591 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms