Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ERCC6Q03468 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ERCC6Q03468 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms