Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CENPEQ02224 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms