Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDK16Q00536 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK16Q00536 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms