Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SKP1P63208 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SKP1P63208 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms