Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
HERVK_113P63121 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms