Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFRD-1P60508 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVFRD-1P60508 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms