Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LINC01547P58512 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms