Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GJA9P57773 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms