Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC19A1P41440 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms