Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FDFT1P37268 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms