Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RYKP34925 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RYKP34925 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms