Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HOXC13P31276 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXC13P31276 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms