Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GTF2E1P29083 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GTF2E1P29083 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms