Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PLNP26678 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms