Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CAPN3P20807 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms