Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LIG1P18858 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LIG1P18858 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LIG1P18858 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LIG1P18858 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
LIG1P18858 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LIG1P18858 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
LIG1P18858 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LIG1P18858 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LIG1P18858 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms