Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms