Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PRG2P13727 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRG2P13727 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRG2P13727 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRG2P13727 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms