Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK4P11802 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK4P11802 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK4P11802 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK4P11802 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDK4P11802 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms