Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCATO75600 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GCATO75600 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GCATO75600 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GCATO75600 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GCATO75600 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GCATO75600 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms