Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F6O75461 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F6O75461 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
E2F6O75461 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
E2F6O75461 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
E2F6O75461 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms