Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP2O75323 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms