Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DENRO43583 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
DENRO43583 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
DENRO43583 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DENRO43583 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DENRO43583 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DENRO43583 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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