Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRRTM2O43300 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms