Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLOCKO15516 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms