Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TO15178 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TO15178 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TO15178 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TO15178 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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TO15178 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TO15178 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TO15178 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TO15178 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TO15178 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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