Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF26H0Y7S4 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF26H0Y7S4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms