Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HNRNPCL3B7ZW38 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HNRNPCL3B7ZW38 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms