Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HMGB1P1B2RPK0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms