Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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SNX13Q9Y5W8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX13Q9Y5W8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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SNX13Q9Y5W8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX13Q9Y5W8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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