Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PAXBP1Q9Y5B6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms