Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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RCE1Q9Y256 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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