Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SETD1BQ9UPS6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SETD1BQ9UPS6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms