Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX7Q9UNH6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms