Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
MKLN1Q9UL63 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms