Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NPC1L1Q9UHC9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms