Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTNNAL1Q9UBT7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms