Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC17A6Q9P2U8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms