Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MBD5Q9P267 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms