Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CAMSAP3Q9P1Y5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CAMSAP3Q9P1Y5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms